بعد الاستيلاء على مدينه طرابلس في عهد سنان باشا قائد الاسطول العثماني عهد الى مراد اغا ادارة طرابلس الغرب والذي كان يتخذ من مدينة تاجوراء مركزاً لنشاطاته الحربيه والتي كان ينطلق منها بالتعاون مع القبائل المحليه لمهاجمة فرسان القديس يوحنا لمحاوله الاستيلاء على طرابلس وعلى الرغم من قصر فترة حكمه في طرابلس الا ان مراد اغا استطاع ان يسيطر على الموقف وقام بترميم الاسواروبناء ابراج جديده وتحصينات متعدده وزاد في تقويه القلاع خوفً من لن تتعرض المدينه لهجمات من القديس يوحنا وما كان يخشاه مراد اغا قد وقع سنة 1552حيث هاج الفرسان القديس مدينة زواره ولكنهم ردوا على اعقابهم ومن جهه اخرى شجع مراد اغا الاهالي الذين فروا من المدينه اثناء حكم الاسبان وفرسان القديس بالعوده للعيش فيها وشيد مراد الكثير من البيوت ورمم ما كان متهدماً من الابنيه لايواء العائدين اليها كما شجع الاهالي على الزراعه والنشاطات التجاريه وانعش البلاد .